Suomen Vanhempainliiton ylin päättävä elin on liittokokous, jota edustavat liiton jäsenyhdistykset. Liittokokous valitsee liiton hallituksena toimivan johtokunnan, johon kuuluu puheenjohtaja ja 10 muuta jäsentä, sekä nimetyt varajäsenet. Johtokunnan jäsenet valitaan kahdeksi kalenterivuodeksi kerrallaan.
Johtokunnan sihteerinä toimii toiminnanjohtaja Ulla Siimes.
Johtokunta 2019
Puheejohtaja
Johanna Laisaari, Helsinki
johanna.laisaari(at)vanhempainliitto.fi
Johtokunnan jäsenet
Jenni Helenius, Hämeenlinna, johtokunnan varapuheenjohtaja 2018-2019
(varajäsen Pia Lundbom, Helsinki)
Katja Hjerppe, Turku 2018-2019
(varajäsen Paula Gassou, Turku)
Elina Johansson, Lohja 2019-2020
(varajäsen Pauliina Pasanen, Vaasa)
Tanja Meronen, Lempäälä 2018-2019
(varajäsen Heidi Pakka, Kurikka)
Päivi Pirnes, Oulu 2018-2019
(varajäsen Karita Nurmela, Espoo)
Annele Rantavuori, Vantaa 2019-2020
(varajäsen Maarit Laurinen, Turku)
Heidi Ristolainen, Espoo 2019-2020
(varajäsen, Päivi Christensen, Järvenpää)
Eeva Takala, Jyväskylä 2018-2019
(varajäsen Maarit Hildén, Sysmä)
Heidi Tuimala, Lieto 2019-2020
(varajäsen Saija Salmi, Kokkola)
Sanna Valtonen, Helsinki 2019-2020
(varajäsen Marjaana Setälä-Hietanen, Pomarkku)