Suomen Vanhempainliiton ylin päättävä elin on liittokokous, jota edustavat liiton jäsenyhdistykset. Liittokokous valitsee liiton hallituksena toimivan johtokunnan, johon kuuluu puheenjohtaja ja 10 muuta jäsentä, sekä nimetyt varajäsenet. Johtokunnan jäsenet valitaan kahdeksi kalenterivuodeksi kerrallaan.
Johtokunnan sihteerinä toimii toiminnanjohtaja Ulla Siimes.
Johtokunta 2020
Puheejohtaja
Johanna Laisaari, Helsinki
johanna.laisaari(at)vanhempainliitto.fi
Johtokunnan jäsenet
Marko Asikainen, Kuopio
(varajäsen Katja Hjerppe, Turku)
Paula Gassou, Turku
(varajäsen Maarit Hildén, Sysmä)
Jenni Helenius, Hämeenlinna
(varajäsen Leena Karjalainen, Jyväskylä)
Elina Johansson, Lohja
(varajäsen Pauliina Pasanen, Vaasa)
Annele Rantavuori, Vantaa
varajäsen Maarit Laurinen, Turku)
Heidi Ristolainen, Espoo
varajäsen Päivi Christensen, Järvenpää)
Marika Salomaa, Porvoo
(varajäsen Suvi Valtonen, Naantali)
Heidi Tuimala, Lieto
(varajäsen Saija Salmi, Kokkola)
Sanna Valtonen, Helsinki
(varajäsen Marjaana Setälä-Hietanen, Pomarkku)
Linnea West, Vaasa
(varajäsen Päivi Pirnes, Oulu)